根據(jù)農(nóng)業(yè)部土壤有機質(zhì)提升項目實施指導(dǎo)意見的要求，為進一步鞏固商品有機肥推廣成果，引導(dǎo)農(nóng)民科學(xué)用肥，提高耕地質(zhì)量，就生產(chǎn)有機肥推廣實施補貼政策,引導(dǎo)農(nóng)民逐步增施有機肥，政策補貼無疑是一個重要的突破口。從2004年上海開始實施有機肥政策補貼，江蘇、山東等地也陸陸續(xù)續(xù)開始實行有機肥的補貼政策。補貼政策推動了有機肥的發(fā)展。
《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第二十七條第三款規(guī)定：企業(yè)從事符合條件的環(huán)境保護、節(jié)能節(jié)水項目的所得，可以免征、減征企業(yè)所得稅。《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》第八十八條規(guī)定：企業(yè)所得稅法第二十七條第（三）項所稱符合條件的環(huán)境保護、節(jié)能節(jié)水項目，包括公共污水處理、公共垃圾處理、沼氣綜合開發(fā)利用、節(jié)能減排技術(shù)改造、海水淡化等。項目的具體條件和范圍由國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門商國務(wù)院有關(guān)部門制訂，報國務(wù)院批準后公布施行。企業(yè)從事前款規(guī)定的符合條件的環(huán)境保護、節(jié)能節(jié)水項目的所得，自項目取得第一筆生產(chǎn)經(jīng)營收入所屬納稅年度起，第一年至第三年免征企業(yè)所得稅，第四年至第六年減半征收企業(yè)所得稅（三免三減半）。實施條例第八十九條規(guī)定：依照本條例第八十八條規(guī)定享受減免稅優(yōu)惠的項目，在減免稅期限內(nèi)轉(zhuǎn)讓的，受讓方自受讓之日起，可以在剩余期限內(nèi)享受規(guī)定的減免稅優(yōu)惠；減免稅期限屆滿后轉(zhuǎn)讓的，受讓方不得就該項目重復(fù)享受減免稅優(yōu)惠。
國家對生物有機肥行業(yè)的最新政策。有機肥設(shè)備，有機肥生產(chǎn)線，有機肥造粒機，有機肥生產(chǎn)設(shè)備。國家層面早在十年前就啟動了以增加土壤有機質(zhì)為重點的“沃土工程”，此后有機肥作為“十一五”重點扶植的肥料品種之一越來越受到黨中央的重視，近年來，“中央1號”文件多次提出“鼓勵農(nóng)民增施有機肥”。然而，目前還沒有國家層面針對有機肥的補貼，化肥行業(yè)享有的能源價格、用電、鐵路運輸?shù)葍?yōu)惠政策卻把有機肥拒之門外（2006年起有機肥免受增值稅），有機肥的運輸價格比化肥要高一倍，只有部分省市開展了有機肥補貼。
最早開展有機肥補貼的是上海市，有機肥設(shè)備，有機肥生產(chǎn)線，有機肥造粒機，有機肥生產(chǎn)設(shè)備。從2004年試點統(tǒng)一采購1.5萬噸有機肥，此后推廣數(shù)量逐年增加，2009年達到16萬噸，2004-2008年有機肥市場指導(dǎo)價為400元/噸，市財政補貼標準時250元/噸，各縣區(qū)增加50-100元/噸的補貼，有關(guān)鄉(xiāng)鎮(zhèn)在此基礎(chǔ)上再給予補貼，2009-2011年的補貼額度為200元/噸。江蘇省2006年開始補貼，每噸由省財政補貼150元，市財政補貼50元；北京在2007年開始實施補貼政策，每噸補貼250元，山東省有機肥補貼于2008年起步，每噸補貼300元。北京有機肥示范推廣主要針對種植大戶和專業(yè)合作社（生態(tài)農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)基地），正是有了補貼他們才開始大面積使用有機肥，進而帶動周邊小農(nóng)戶使用有機肥。
山土地揭陽土地昆明土地綏化土地長沙土地四平土地陜西土地呼倫貝爾土地晉中土地牡丹江土地錦州土地保定土地黃岡土地大慶土地東莞土地畢節(jié)土地巴中土地清遠土地蘇州土地德州土地重慶土地
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